優化網站結構有兩層含義：一是物理結構，二是邏輯結構。

網站的物理結構是指由網站的真實目錄和文件存儲位置決定的結構。

一般來說，有兩種更好的物理結構。一種是平面的，即所有網頁都存在于網站的根目錄中。這樣所有這些頁面都位于根級別，形成一個扁平的物理結構。

這更適合小型網站，因為如果在根目錄中放置了太多文件，那么生產和維護就更麻煩，也更容易搞砸。

第二種是樹形結構，即根目錄被劃分為多個通道，或稱為類別、目錄等。無論名稱是什么，其含義都是相同的，然后屬于每個通道的網頁被放置在每個通道下。例如，通道分為：

將特定內容頁置于頻道下：

網站結構的第二層含義是指邏輯結構或鏈接結構，即網頁內部鏈接形成的邏輯或鏈接網絡圖。

更好的情況是，邏輯結構與之前的樹物理結構一致，也就是說，主頁鏈接到所有頻道，主頁通常不直接鏈接到內容頁，除非它是你非常想推的幾個特殊頁面，所有頻道主頁都連接到其他頻道的主頁。頻道主頁連接到網站的主頁。頻道主頁也連接到各自頻道的內容頁。通常，頻道主頁不會連接到其他頻道的內容頁。所有內容頁都連接到網站的主頁。所有內容頁都連接到各自上級頻道的主頁。內容頁可以連接到同一頻道的其他內容頁，但通常不連接到其他頻道的內容頁。在某些情況下，可以使用適當的關鍵字將內容頁連接到其他頻道的內容頁。

仔細閱讀前面的句子后，你可以清楚地看到，這些鏈接將自然地形成一個樹狀網絡圖，這個邏輯或鏈接的網絡可以與物理結構重合或不同。例如，平面物理結構網站也可以通過鏈接形成邏輯樹結構。對于搜索引擎來說，更重要的是鏈接形成的邏輯結構。

收藏是否容易取決于點擊幾次后與主頁的距離，而不是它的實際位置。

對于規模較小的網站，一般樹狀邏輯結構的網站更好。